Waarom zie ik 's avonds/'s nachts witte en rode lichtjes met een interval knipperen in de matrixborden boven de snelweg? Waar dient dit voor?

Dat komt omdat die borden niet uitgezet kunnen worden. Daarom word er gewoon elke 10 seconden een stipje als signaal erheen gestuurd.
Je ziet het ook vaak op van die wegwerkzaamheden matrix borden (zo'n geel karretje langs de weg), daar staat dan ook alleen een stip in beeld in 1 van de hoeken.

Toegevoegd na 1 dag:
Ik heb op Wikipedia nog wat gevonden:

Als de communicatie tussen onderstation en verkeerscentrale bijvoorbeeld wegvalt, dan zullen de onderstations na 16 seconden zonder lifesign zelfstandig doorgaan met het plaatsen van AID-beelden, echter met behoud van de meest restrictieve, reeds opgelegde beelden. Dat betekent dat een kruis net zo lang blijft staan totdat de communicatie met de verkeerscentrale is hersteld. Hetzelfde gebeurt totdat het onderstation langs de weg, in de kast, een reset krijgt. Tevens worden dan de flashers in een file niet meer onderdrukt. Dergelijke situaties hebben al meermaals de krant gehaald, omdat kruizen van nachtelijke wegwerkzaamheden niet meer konden worden verwijderd en de ochtendspits te maken kreeg met ernstige congestie.