Waarom knipt het enzym pepsine geen Valine, Alanine of Glycine?

Dit is inderdaad een moeilijke vraag, en hij is zelfs niet eenduidig te beantwoorden, omdat er voor Valine, Alanine, en Glycine elk afzonderlijke redenen zijn waarom pepsine daar niet zal knippen.

Het heeft te maken met de vorm van deze aminozuren, en de vorm van het enzym pepsine.

Een enzym is vaak een groot en complex eiwit, dat elastisch is, en van vorm kan veranderen, en waarvan het actieve deel heel precies op bepaalde moleculen past.

De drie aminozuren die jij noemt hebben waarschijnlijk bepaalde polaire gedeeltes, of uitstekende onderdelen waardoor pepsine er niet meer precies op past.