Een scherm gedeeltelijk afdekken? Ik weet niet of dat letterlijk mogelijk is.
Wat wel kan is gebruik maken van meerdere virtuele bureaubladen (degene die niet actief zijn, zijn ook 'bedekt').
In Ubuntu bijvoorbeeld heb je standaard 6 virtuele bureaubladen ingesteld.
Er bestaan echter ook tools om hetzelfde effect in windows te bereiken zoals virtuawin, microdesk, etc...