Via Itunes upgraden van iOS versie 4 - 5 wordt eerst een reservekopie (backup) gemaakt van al je instellingen. Dan wordt iOS 5 geinstalleerd na afloop worden de instellingen uit de reservekopie terug gezet. Soms kan dit problemen opleveren doordat functies en instellingen uit iOS4 niet goed meer werken op iOS5 en krijg je soms dat applicaties rare capriolen uithalen.
Bij upgrades binnen de versie 4.x of 5.x dus van een versie 4.0.0 naar 4.0.1 of 5.0.0 naar 5.0.1 bijvoorbeeld blijf je binnen dezelfde versie en treden deze problemen niet op.
Maar er wordt zeker eerst een backup gemaakt door iTunes en deze wordt later terug gezet. Deze optie is af te breken of te annuleren en dan zal je na de upgrade met een schone lei beginnen.