zijn donkere kleuren altijd dominant boven de andere kleuren in genen?

Nee hoor. Kijk bijvoorbeeld naar schildpadpoezen:

Het gen voor rood ligt op het x-chromosoom. Daar heeft de poes er twee van. Als op het ene x-chromosoom het gen voor rood ligt, en op het andere voor niet-rood (zwart), wordt de poes niet zwart. In plaats daarvan activeert per haarwortel één van de twee genen compleet willekeurig, waardoor een rood-met-zwart patroon ontstaat.