Hoe kan een landelijk referendum worden aangevraagd bij twijfel politiek besluit?

Als je het burgerinitiatief bedoelt: dan moet je eerst 40000 handtekeningen verzamelen, zie: http://nl.wikipedia.org/wiki/Burgerinitiatief
Zo kun je een onderwerp op de agenda van de Tweede Kamer laten plaatsen.
Een andere weg is het spelen via de politieke partijen.

Een echt referendum wordt door de overheid uitgeschreven, eventueel in opdracht / op verzoek van de bevolking. Ook dat zul je dan via de partijen/Kamerleden moeten spelen, omdat dat de volksvertegenwoordigers zijn in de Kamer.
Zie voor meer info: http://nl.wikipedia.org/wiki/Volksraadpleging